Im November 1998 wechselte Nikl zum 1. FC Nürnberg ins Frankenland. Mit dem Club stieg er 1999 und 2003 aus der Bundesliga ab. Bis zum Trainerwechsel von Wolfgang Wolf zu Hans Meyer gehörte er meistens zur Startelf. Unter Hans Meyer wurde er von einigen jungen Spielern verdrängt. Das Highlight seiner Zeit beim 1. FC Nürnberg war der Pokalgewinn im Jahre 2007. Beim Endspiel in Berlin kam er erst kurzfristig in die Mannschaft, nachdem sich Berti Glauber beim Aufwärmen verletzte. Zur Saison 2007/2008 wurde er in die 2. Mannschaft des 1. FC Nürnberg verschoben. Im September 2007 wurde sein Vertrag beim Club aufgelöst. GlubbWiki